SILAC定量蛋白质组
2002年，丹麦Mann实验室的OngSE等对AACT技术作了进一步改进，建立了SILAC技术并首次应用于定量蛋白质组研究，为全面、系统地定性和定量分析复杂哺乳动物细胞蛋白质组提供了有效的方案。
磷酸化蛋白质组
翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式，在生命现象的许多关键调节机制中，蛋白质的磷酸化是重要的翻译后修饰，它与信号传导，细胞周期，生长发育以及癌症机理等诸多生物学问题有密切关系。
修饰技术-N糖基化Label Free标记定量
蛋白质在酶的作用下被连接上糖链的修饰类型。细胞内超过50% 的蛋白质都修饰有糖链。N- 糖基化是指糖链连接于天冬酰胺（Asn）残基上的糖基化形式，参与细胞识别、免疫应答、细胞分化等生命活动
蛋白质修饰底物与PTM催化酶的底物高通量鉴定
iTRAQ/TMT蛋白组定量分析 SILAC蛋白组定量分析 Label Free非标定量分析 半定量分析（spectral count） 鸟枪法蛋白全谱分析 2D蛋白胶点鉴定 单一蛋白高覆盖度分析